En teoría, y según palabras de discreet, se ha hecho un esfuerzo para que todos los plugins que funcionan con el max 4.x lo hagan bien bajo el max 5
(Lo cual, fantaseando un poco, puede significar dos cosas: o no han cambiado casi nada entre ambas versiones, o se han esforzado porque tienen claro que se le iba a subir todo el mundo a la chepa por tener que actualizar los plugins).

Sin embargo, por el foro ya se han comentado algunas incompatibilidades, aunque no sabría decirte si se deben directamente a los plugins en sí...o a su manera de "registrarlos".
Saludos,
Drakkhen_Rotor