javier, haz esto:
En el directorio de 3ds max tienes el archivo
3dsmax.ini.
Edítalo con el block de notas, y busca la etiqueta
[MtlEditorPosition].
Los dos primeros valores del parámetro
MainWindow definen
la posición de la ventana del editor de materiales.
Cambia esos valores (x, y) por unos que te permitan volver a ver la ventana,
por ejemplo (100 100).
Guarda el archivo 3dsmax.ini.
Ya está.
Espero que se te arregle con esto.
En el archivo 3dsmax.ini se definen muchas cosas de la configuración de max.