Yo no estoy muy puesto en Linux, pero buscando por ahí encontré que los discos duros, memorias usb, etc al ser reconocidos se almacenan en el fichero FSTAB, en principio comentando las líneas donde te aparecen los discos duros que no quieres ver ya te debería funcionar. Un poco de info en:
Linux en Español :: Ver tema - manual fstab