Sigo haciendo pruebas, y al final parece que era el método: si elegía el Cross correlation (entonces te deja elegir el método de análisis de correspondencia) no me lo hacía. Al cambiar de método a KLT empieza a funcionar... también hay que fijarse en la sección Estimation: aunque al cargar los ficheros le decía que era free move, lo tenía seleccionado como rotation. No sé, un poco de todo.
Ahora estoy investigando, no calcula bien la focal. Eso sí, la cámara es una

así que no espero milagros. Pero algo interesante sí hace, sí...