No es un bug (perdona oh gran Caronte por contradecirte pero para mi eres como un dios)
A mi me pasa lo mismo, pero una pregunta le pones el objeto a un hueso que controla, o a un hueso que forma parte del esqueleto. De todas maneras supongo que modificando el objeto en modo edición conseguiras rotarlo, escalarlo de tal manera que luego te salga bien a la hora de asignarlo al hueso.
Madre mía que lio...
A ver si alguien te puede ayudar porque yo me he quedado con los objetos (los cuales los hago con líneas no con mesh) tal y como me han aparecido, no me han molestado que estén rotados.
Saludos
adie