Casi seguro que tienes alguna cara interna.
Ponte en modo alambre (wireframe) y en selección de caras (face select)
Así podrás ver si tienes alguna cara en el interior. Piensa qué los modelos deben ser perfectamente huecos sin paredes interiores. Y la borras.
Archivo adjunto 183744
Luego hay otra forma de ver directamente si las caras están invertidas.
Estando en Edit Mode miras en el panel de la derecha (letra n) y activas la opción normal - caras y veras unas líneas azules que deben de apuntar todas hacia fuera.
Si alguna esta invertida, se selecciona y se gira con Flip Direction.
Archivo adjunto 183745