Diría que tienes la distancia de retracción demasiado alta y es por eso, no obstante, para retirar bien los soportes lo que tienes que hacer es configurar en CURA algunas cosillas en el apartado de soporte, te pongo como lo tengo yo y me funciona bien.
Densidad de soporte entre 10% y 20% va bien(yo lo tengo al 10%).
Habilitar borde de soporte=si
Distancia en Z del soporte=0.2(esto es para capas de 0.2 milímetros, si imprimes con capas más finas tendrás que adecuarlo a dicha capa, es cuestión de probar, lo que hace es que tengas una pequeña separación entre el soporte y la parte de la pieza que esta sujetando, a mayor distancia más fácil te será retirar el soporte, pero si es demasiado no va a sujetarla correctamente, y tendrás algún descolgamiento de material).
Habilitar interfaz del soporte=si(esto crea una capa solida entre el soporte y la pieza, y ayuda que la sujete mejor, y a la vez sea más fácil de retirar el soporte).
Habilitar techo de soporte=si
Habilitar suelo de soporte=si
0.2 para piezas con detalle es demasiado alta, para esos casos es mucho mejor 0.12, la Ender 3 puede imprimir hasta 0.06,y eso ya si se podría decir que es muy refinado, yo para piezas normales uso 0.2, para piezas con detalle 0.12 y para piezas grandes y que me dé igual el acabado 0.28.
Eso varia mucho dependiendo de cada impresora, porque afecta bastante la distancia de tubo de teflón que le tengas puesto, la calidad del mismo, etcétera, yo es que la mía ahora la tengo con extrusión directa, y lo tengo a 0.2mm y 45mm/s de velocidad de retracción, pero si no recuerdo mal en bowden la tenia a unos 5,5mm-6 milímetros y 45 milímetros por segundo, pero nunca conseguí eliminar los hilillos por completo.
también influye y mucho la temperatura, cuanta más baja sea, más fácil te va a ser controlar las retracciones, el problema es que el extrusor de serie de la Ender, no tiene mucha fuerza.
Lo mejor es que imprimas un test de retracciones como este https://www.thingiverse.com/thing:909901, prueba a distintas temperaturas, distancias y velocidades hasta que des con la que mejor te vaya.
Te pongo un enlace a un video de miguel en el que lo explica muy bien.