Entendía qué las líneas ocultas eran las aristas que sólo se ven en modo edición. Nada, nada. Por cierto, en la 2.49 tienes esas opciones en el mismo sitio (botón objeto)
Está claro que sólo te queda quitar a mano esas líneas y hacer una buena edición, pero no creo que sea para tanto. De otra forma, puedes hacer un render con Edges o Freestyle, y pasarle el vectorizador. No creo que pierdas mucha precisión, pero en cualquier caso, para ese tipo de trabajo. ¿la necesitasí.