Hola.
Depende del flujo de trabajo. Si el modelo ya está completamente simétrico y no necesitas más ediciones con el Mirror, aplicarlo puede evitar problemas con el Weight Paint y deformaciones inesperadas. Sin embargo, si aún estás ajustando la geometría, dejarlo sin aplicar te permite modificar una mitad y reflejar automáticamente los cambios.
Lo ideal es que el Armature esté por encima de Subdivision Surface en la pila de modificadores. Esto garantiza que la deformación del esqueleto afecte primero al modelo en baja resolución y luego el Subdivision Surface suavice la malla, evitando deformaciones extrañas y mejorando el rendimiento.
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